A UM presta grande importância à investigação e inovação em ciências e tecnologia, reunindo equipas de investigação de excelência em diversas disciplinas e realizando contributos significativos nas áreas de ciências, humanidades e ciências sociais. De acordo com as estatísticas do ISI Web of Science, o número de artigos académicos de alta qualidade publicados por membros da UM cresceu constantemente, de 72 em 2007, para 2,500 em 2023.